《双宝联盟爹地是大佬》是由执导主演的一部《魔法禁书目录3》延续了系列作品的精彩设定，故事背景设定在东京西部的巨大“学园都市”，这里总人口达230万人，其中约8成是学生。都市内实施着超能力开发的特殊课程，学生们的能力被分为从“无能力Level 0”到“超能力Level 5”的六个阶段。主人公上条当麻是一名普通高中生，却因右手中隐藏的“幻想杀手”——一种能消除任何异能之力的神秘力量，而被评价为最低的“无能力者”，过着充满不幸的生活。
然而，上条的学生生活在暑假开始时发生了翻天覆地的变化。一天，一位纯白修女从天而降，她正是逃离“魔法”世界的“禁书目录”茵蒂克丝。自从与茵蒂克丝相遇，上条被卷入了一系列科学与魔法交织的惊险事件中。他不仅要面对学园都市“科学”方的复杂势力，还要应对与茵蒂克丝相关的“魔法”方的挑战。在解决这些事件的过程中，上条的人际关系逐渐扩展，命运也随之改变。
本季中，魔法一方的十字教最大宗派罗马正教终于注意到了上条的存在，开始对他展开行动。与此同时，科学方的学园都市也有所动作，科学与魔法之间的对立日益加剧。但在这场全球性的冲突中，一些英雄挺身而出，他们通过与上条的关联，使命运大为改变，勇敢地与世界对峙。这些角色包括阿部敦配音的上条当麻、井口裕香配音的茵蒂克丝等众多声优演绎的丰富人物。
故事在科学与魔法第三次交织之时大幅推进，充满了紧张刺激的战斗、深刻的情感纠葛和意想不到的转折。观众将跟随上条当麻和他的伙伴们，探索这个充满超能力与神秘魔法的世界，见证他们如何面对挑战、成长并守护重要的事物。《魔法禁书目录3》不仅剧情紧凑、画面精彩，更通过生动的角色塑造和引人入胜的叙事，为观众带来一场视觉与情感的盛宴。
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